Umhverfisráðherra skipar forstjóra Landmælinga Íslands og ber hann ábyrgð gagnvart ráðherra í samræmi við lög og skipurit stofnunarinnar. Forstjóri stjórnar daglegum rekstri, ber ábyrgð á starfsmannamálum stofnunarinnar og stuðlar að því að stofnunin vinni á grundvelli laga sem gilda um starfsemina.
Forstjóri er Eydís Líndal Finnbogadóttir.